有關臺北市議員批評臺北市不疫調及發包中心不得代辦疫苗採購一事，臺北市政府衛生局嚴正澄清。
臺北市衛生局表示，醫療機構通報COVID-19採檢陽性個案後，即立刻啟動疫情調查，防疫人員會逐案調查確診者健康狀況、檢驗報告、密切接觸者與足跡等資料，並匡列接觸者，進行接觸者隔離、採檢與健康追蹤關懷及環境清消等防疫措施。疫調目的為釐清感染源與阻斷傳播鏈，為疫情防治的重要工作，且疫調資料都會逐案上傳中央法定傳染病系統，中央也會逐案檢視，不可能發生不疫調情形。
為即時發現社區潛在個案，臺北市自110年6月16日起進行精準疫調，以確診者為中心，採同心圓模式執行疫情調查，除匡列密切接觸者，亦針對有接觸、足跡重疊、有感染風險之其他接觸者擴大匡列及安排採檢，包括接觸者的同住家人、同場域之同事或同校師生等，並追蹤採檢結果及健康狀況，更積極降低潛在社區傳播鏈，達冷區殲滅、熱區圍堵降溫的疾病防治措施。
疫苗採購依作業程序由北市工務局聯合採購發包中心辦理
依據「臺北市政府工務局代辦採購案件作業程序」，北市工務局代辦採購時，以代辦機關預算金額達新臺幣伍佰萬元以上採購為原則，且優先選擇代辦預算金額較大或北市重要採購。
 
北市新冠肺炎疫苗採購為藥品採購，屬重大採購且為巨額採購，與聯合醫院例行性藥品採購有所不同。為求審慎周延，將請臺北市政府工務局聯合採購發包中心協助辦理招標作業。