臺北市政府表示第一果菜及魚類批發市場改建後營運設備經費估算約為27.94億元，其中臺北農產公司佔約15.34億元，主要項目為冷藏庫、拍賣作業系統及網路系統、低溫卸貨區及垃圾處理設備等；臺北漁產公司佔約12.6億元，主要項目為冷凍冷藏系統、中央空調系統、拍賣作業系統、拍賣網路系統、製冰廠及售冰處等。

 
 

       有關媒體報導改建後之第一果菜及魚類批發市場添購設備，由市府墊付一事，市府基於農產品批發市場屬公用事業，涉大臺北地區民生必需供應，以及考量營運設備需隨著改建工程一併到位，遂採取先行編列全額營運設備預算，並送議會進行審查，同時也請臺北農產公司及臺北漁產公司積極向中央單位爭取補助款，以降低公司負擔。部分議員建議營業設備經費由兩公司採用增資、貸款以及墊府款之利息部分，市府將以不影響整體工程進度及維持民生需求為原則下進一步評估。