因應本次米克拉颱風可能帶來之雨量，台南市長黃偉哲指示成立米克拉颱風災害應變中心，台南市政府已於今(10)日下午4點半成立二級一階開設，由消防局、警察局、民政局、工務局、環境保護局、社會局、新聞及國際關係處及臺南市後備指揮部等機關進駐，各區公所亦同步開設，隨時提高警戒，待命處理雨勢可能帶來之災情。 
 台南市政府秘書長方進呈兼副指揮官，隨即於5點主持米克拉颱風災害應變中心第一次工作會報，特別轉達市長黃偉哲的指示，要求各局處完成整備。水利局除已針對易淹水防汛熱點部署移動式抽水機外，更已加強各防汛設施包括水門、抽水站、移動式抽水機、滯洪池的檢查及整備工作，人員、油料、沙包均已備妥；相關在建工程防汛缺口的檢視、雨水下水道及道路側溝清淤工作也已完成。 
 水利局及警察局利用智慧科技，加強下水道水位及道路淹水之監看及管制，做好相關通報，以防嚴防駕駛人誤闖，保障民眾安全。另適逢本市龍眼產期，及文旦生長期，請農業局通知農民及早因應。 
 另依據中央氣象局之雨量預報，台南市今夜入夜後至明日清晨8點以前將有雨勢，請沿海地區及易淹水地區民眾要加強戒備，全市３７個公所已備妥砂包最低安全存量超過10萬包，民眾如有需求請洽所轄區公所就近領取；水利局也備有9.5萬包，共計19.5萬包作為供民眾領用。