依中央氣象署預報情資顯示，臺南地區受到颱風外圍環流及熱力作用，午後對流雲系發展旺盛，有局部大雨或豪雨發生，截至16時止，最大時雨量為新化84毫米、新市75.5毫米、永康73.5毫米，最大10分鐘雨量為東山28.5毫米、南化26毫米、仁德及新市24.5毫米、歸仁及山上24毫米。 
 水利局表示，本波降雨截至16時止，計有新市衛生排水、永康分洪、仁德嵌腳等36座抽水站啟動抽水，總抽水量約96萬噸。本次強降雨皆已超過側溝保護標準(10分鐘10-12毫米），致局部區域宣洩不及有短暫積水情形，尚不影響用路人通行，且皆於降雨趨緩後迅速退水。 
 水利局補充說明，本波降雨安南區長谷鳳凰城大樓地下室溢淹一事，因強降雨導致側溝無法負荷溢出，降雨減緩後利用地下室原有抽水馬達抽排退水，車輛無泡水受損，電梯也未進水。另永康區中正路涵洞已於下午3時退水、大同地下道、小東地下道也於下午3時20分恢復通行。 
 黃偉哲市長提醒市民，因應近期對流雲系發展旺盛影響，出門時請攜帶雨具及注意行車安全。也籲請市民朋友可多加利用「臺南水情即時通APP」，隨時瞭解水情狀況，提早防災、避災。另若發現側溝落水口、水溝蓋或私人溝渠有樹葉、雜物阻塞或塑膠墊覆蓋，請市民朋友協助清除或通報市府協助處理，避免阻礙水流。

中央氣象署9月5日豪雨特報 
  
 海尾寮抽水站起抽 
  
 永康區中正路涵洞已退水 
  
 小東地下道已恢復通行 
  
 中正南路退水