儘管國軍落實「性別主流化」政策的績效廣受社會各界的好評，但不容諱言，在兩性相處方面，軍中仍有極少數官兵因觀念錯誤或偏差，未能自持而肇生性騷擾案件，對個人、單位，甚至整體國軍的形象，造成傷害。
「性騷擾」問題層出不窮，受害者常為了顧及顏面或保住飯碗而隱忍下來，不僅個人人格尊嚴無法維護，職場亦無法適切保障其人身安全，造成當事人即使鼓足了勇氣揭發事件，最後還必須獨自承擔工作場所閒言閒語、不被信任，甚至被迫離職等情事，身心受創至鉅外也影響其工作權益。
「尊重」不僅是兩性和諧關係的基礎，也是人與人互信互動的要素，國軍全體人員，不論在兩性或同性之間的相處上，都應秉持「相互尊重」的精神，行為舉止發乎情、止於禮，不可因為彼此階級之不同，而輕忽在公私領域上應有的分際，甚至企圖以權謀私，以滿足自己一時的私慾。國防部亦重申「一旦犯案查證屬實，不論階級高低，一律依法懲處，以嚴肅紀律」的基本原則。