推動「性別平等」不僅是國家既定政策，也是世界的潮流與趨勢。推動這個工作，不是消極的免除性別歧視，應該更積極建構友善的性別平等環境。配合國家政策指導，本部自民國96年成立「性別平等專案小組」，並區分9個分工小組，由四位性別平等專家擔任外聘委員，共同檢視「性別平等政策綱領」、「性別主流化」、以及「消除對婦女一切形式歧視公約」等工作的推動，另為使性別平等機制向下延伸，各軍司令部亦於民國100年陸續成立「性別平等工作小組」，全面落實推動性別平等工作。
「性別平等」不是口號，也不是男性與女性的戰爭，它是重視性別平等的實踐，是對人性尊重與關懷，期待不同性別間能夠學習共處共事，創造和諧的性別互動關係，凝聚部隊團結向心，以確保任務達成，創造「多贏」的契機。再完善的法令規章，若人的因素無法配合，一切均是惘然。各級指揮官須瞭解官士兵生活、成長環境、背景、性格，以專業、熱忱領導全體官士兵，以身作則，尊重個案獨特性與權益，不因其性別取向而有所差異；而各級幹部更應落實法令宣導，要求官兵嚴守各項紀律，注意行為規範，主動發掘問題，俾防微杜漸，建立國軍優良形象。