工務局表示，有鑑於北門分院歷經嚴重傷亡火災事件，所以設計時特別注重「結構安全」、「逃生避難」、「去機構化」、「破舊立新」4個方向，來打造更安全、溫馨、明亮的長照中心。建築物抗震能力由原本可以抵抗5級地震提升到6級地震。每間房間設有防火防煙門，可以就地避難，且有兩座無需電力，即可以將人員從高樓層送至地面層的無動力避難梯。
在建築物歷經慘重的火災傷亡變故，使得人跡罕至而閒置多年後，衛生福利部於107年核定整建經費3億元，工程導入嚴謹風險評估與綠建築規劃設計概念，以最少的廢棄物製造，讓破舊不勘建築物創新安全性與機能性復生，整建成提供165人的日照與長照機構，成為閒置空間再利用的優良案例。
這項工程的重大特色為經濟效益與節能減碳的成效卓著，工程以整建的方式進行，經費3億元、施工期2年1個月，如以重建的方式，經費將高達6.5億，施工期至少3年，且以建築物全生命週期所產生的二氧化碳排放量來計算，整建工程比重建可減少48,730公噸二氧化碳排放量，相當於為地球保留了88,600棵大樹。
以「簇群式照護單元」的方式配置，以便於照護者對於住民在生活起居上的照料，以及「團體家屋」(Group Home)的方式配置，可營造「家」的溫馨感；內部空間有柔和色調與順暢的動線，建築外觀則以多彩亮麗來凸顯濱海建築。
工程進行中，曾遭遇COVID-19疫情嚴重衝擊，帶來國際航運問題及施工人力缺少等困難，所幸在新營醫院、臺南市政府與工程團隊協調合作下，共同努力終於達成衛服部核定今年完工的目標。
整建完成後的北門分院為4層樓，1樓做為居家醫療資源中心、餐飲服務中央廚房、一般日間照顧中心等為主；2樓做為失智症日間照顧中心、長期資源整合中心及失智症團體家屋等；3、4樓則為住宿式長照機構，透過單元照顧模式，提供溫馨空間，並有利維持照顧及管理品質。
北門分院工程在市府副秘書長邱忠川率隊及工業局蘇局長督導下，今天獲得中央「第22屆公共工程金質獎」建築類佳作的肯定。
