在防毒與戒菸任務上，國防部一向極為重視，不僅入營官兵在體檢時，一律透過驗尿剔除有毒癮者，更於官兵休假回營時，不定時進行驗尿，讓官兵知所警惕，不敢涉足不當場所；另一方面，鑑於軍人是各行各業壓力最大的工作之一，世界各國的部隊，都有軍人以吸菸來紓解壓力，因此，各國莫不積極推廣「軍人戒菸」、「無菸營區」，打造無二手菸公害環境，維護不吸菸者健康。

戒菸與拒絕二手菸，是當前先進國家增強國力與提升戰力主要工作。國防部自民國92年起，即與衛福部攜手合作，搭配專業之國軍醫院，成立戒菸門診。為避免不吸菸者墜入吸菸淵藪，亦明定「吸菸區設置規範」，依單位實際情況，逐年裁減吸菸區，並嚴格執行彈藥庫等易燃易爆場所全面禁菸，以建立營區無菸支持環境，維護官兵安全與健康權益。