因應軍事審判法修正維持戰時審判機制，承平時期軍法機關不再辦理偵查、審判案件，但仍須保留戰時軍事審判的種能，以專注法治教育、法律服務及國防法制等法律事務。雖然國軍面臨軍法重大改革，不免遭受衝擊與震盪，；但是在行政院的支持下，國防部引領政策改革，檢討軍法的任務、功能與職掌，目前已初步完成職能轉換及組織調整，編成地區法律服務中心，軍法官編配各級部隊及政治作戰局，裁撤軍事監獄及南、北兩座軍事看守所，藉由制度性轉型，以達到維護國家整體安全，貫徹國軍依法行政，確保軍事任務達成。