九三軍人節的由來，是紀念國軍對日抗戰獲得最後勝利的特別日子。時序可追溯自民國二十六年爆發「七七事變」後，對日抗戰前後共歷時八年，但前四年幾乎全由我國獨立支撐，以落後武器抵禦日本以現代化裝備的無情侵略。直至日本偷襲美國珍珠港後，引起英美公憤並對日宣戰，我國遂得以與盟軍並肩抗日，才逐漸扭轉戰局。到了民國三十四年八月六日、九日，美軍先後在日本廣島、長崎兩地投下原子彈，日軍終於在八月十日宣布無條件投降。
抗戰勝利後所舉行的受降典禮，於當年九月二日在停泊於日本東京灣的美軍「密蘇里」號艦艇上舉行。而中國戰區的受降典禮，則於九月九日上午九時在南京中央陸軍官校舉行，日本降使岡村寧次代表在中國境內，及越南北緯十六度線以北地區的所有日軍，向我國最高統帥呈遞降書，我國由何應欽將軍代表受降，象徵結束這段艱苦的抗戰歲月。為紀念這段日子，國民政府乃於民國三十五年四月，決定將每年九月三日訂為抗戰勝利紀念日，並於當日舉行中樞秋季國殤大典，此即軍人節的由來。