國軍在我國民主化轉型後政治教育的目標，早已脫離塑造「黨軍」文化，而是在讓每一位軍人均能透過學習的過程，而瞭解、認知「軍隊國家化」之的必要與軍人、軍隊在政治上應有的角色分際，從而形成對認同民主價值的信念與軍隊的文化。因此，國軍的政治教育與其說是「思想教育」不如界定為「愛國教育」或「認識民主政治」、「建立軍人民主信念」的教育。國軍的政治教育是政戰制度的主要工作之一，其目標在於，一方面透過通識教育和「國是共識」教育，培養人格均衡、學養豐富、忠貞愛國、守法重紀，具民主法治素養的軍官幹部(穿軍服的健全公民)；另一方面透過精神教育，陶鑄一個有民族精神、忠貞志節、敵我意識及犧牲 奉獻精神的標準軍人。
威權時期基於意識形態及人治色彩深厚而推動的政治教育內容，在後來的民主化時期逐漸遭遇到不少質疑。另外統獨意識形態的爭議，向來是軍中政治教育方向掌握的難題。軍方如何在統獨意識上的衝突以及部分人民主張甚至堅持尋求台灣的獨立中，調適官兵的認知和凝聚官兵的共識，來建立起文人至上的倫理和行為模式，是國軍政治教育必須要面對的重要課題。