性別平等是兩性教育中極為重要的概念之一，所謂「性別平等」就是「性別」和「平等」的組成，「性別」除了一般社會大衆對人體生理結構差異的認知外，還包括傾向不同者（如：同性戀者）和社會生活及文化層面上約定俗成的性別概念（例如：女主內、男主外、男兒有淚不輕彈）。
「平等」即是一種立足點上的公平對待，其不因性別不同而有所差異，對性取向不同者（如：男同性戀者、女同性戀者等）也應給予相當的尊重，而在性別平等上，兩性應積極地追求相互尊重、包容差異，消極地避免性別歧視或偏見。性別平等在教育上的推動，即期使社會早日達成「兩性平權、相互尊重」的真善美境界。